超聲波清洗機的頻率是影響清潔效果的核心參數之一，不同頻率產生的超聲空化效應存在差異，進而適配不同材質、不同污漬類型的工件清潔需求。
低頻（通常20-40kHz）超聲波清洗機，空化泡體積較大，破裂時產生的沖擊力更強，適合去除工件表面頑固污漬，如金屬零部件上的厚重油污、銹蝕等。不過，較強的沖擊力可能對精密、脆弱工件造成損傷，因此這類頻率更適用于結構堅固的金屬件清潔。
中頻（40-80kHz）超聲波清洗機，空化效應強度適中，空化泡分布更均勻，既能有效去除中等難度污漬，又能減少對工件的損傷，廣泛應用于電子元件、珠寶首飾等中小型精密件的清潔。
高頻（80kHz以上）超聲波清洗機，空化泡體積小、數量多，破裂時沖擊力較弱但作用更精細，適合清潔工件表面細小縫隙、微孔內的污漬，如光學鏡片、醫療器械上的細微污垢，同時能避免對高精密工件表面造成劃痕。
選擇超聲波清洗機頻率時，需結合工件材質、污漬頑固程度及表面精度綜合考量，才能充分發揮清潔效果，保護工件不受損傷。